中國科學院海洋研究所科研團隊歷時10年成功破譯凡納濱對蝦（又稱“南美白對蝦”）基因組，并獲得高質(zhì)量的對蝦基因組參考圖譜，研究成果在《自然》雜志子刊《自然通訊》在線發(fā)表。
中國科學院海洋研究所研究員相建海介紹，對蝦基因組是世界上公認的高復雜基因組，中國科學院海洋研究所科研團隊嘗試了從一代到三代的各種基因組測序平臺及各種組裝軟件，最終完成了凡納濱對蝦的全基因組測序和組裝，并獲得了高質(zhì)量的對蝦基因組參考圖譜。
通過分析發(fā)現(xiàn)，凡納濱對蝦共有約24億個堿基對。以1-6堿基為單位多次重復的簡單串聯(lián)序列（SSR）占對蝦基因組的23.93%以上，是目前已測基因組物種中含量最高的，這也是對蝦基因組高復雜性的根本原因。
此外，科研人員在對蝦基因組上發(fā)現(xiàn)了兩大結(jié)構(gòu)特征：大量的物種特異性基因和大量的串聯(lián)重復基因，這可能與對蝦科的特異性進化有密切聯(lián)系。
中國科學院海洋研究所研究員李富花表示，對蝦基因組的破譯，為甲殼動物底棲適應和蛻皮等研究提供了重要理論基礎和數(shù)據(jù)支撐，同時也為對蝦基因組育種和分子改良工作提供了重要基礎平臺。
據(jù)了解，凡納濱對蝦作為四大養(yǎng)殖蝦類之首，其全球年產(chǎn)量達416萬噸，具有非常重要的經(jīng)濟價值。我國的凡納濱對蝦產(chǎn)量占全球的四分之一以上。由于種質(zhì)資源匱乏，我國每年需從國外引進大量凡納濱對蝦苗種。
“凡納濱對蝦基因組的破譯，將有力促進我國對蝦分子育種和全基因組育種的發(fā)展，產(chǎn)生我國自主培育的凡納濱對蝦品種，推動我國種業(yè)發(fā)展。”李富花說。